Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arrdc1Q99KN1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arrdc1Q99KN1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms