Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms