Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps4Q99KG7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps4Q99KG7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps4Q99KG7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms