Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims1Q99JW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims1Q99JW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lims1Q99JW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms