Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlcd1Q99JT6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms