Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctu1Q99J10 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms