Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn16Q925N4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn16Q925N4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn16Q925N4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn16Q925N4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn16Q925N4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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