Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrif1Q923B3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrif1Q923B3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms