Protein–RNA interactions for Protein: Q922M5

Cdca7l, Cell division cycle-associated 7-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7lQ922M5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca7lQ922M5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca7lQ922M5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca7lQ922M5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca7lQ922M5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7lQ922M5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7lQ922M5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms