Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l1Q920A7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l1Q920A7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.3 ms