Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf6Q91YR7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf6Q91YR7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf6Q91YR7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms