Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpm2Q91YD4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpm2Q91YD4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm2Q91YD4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm2Q91YD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms