Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Basp1Q91XV3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms