Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Creb3l3Q91XE9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms