Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc3Q91W40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms