Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd3Q91W18 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd3Q91W18 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms