Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms