Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6lQ8VEG6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6lQ8VEG6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms