Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba5Q8VE47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba5Q8VE47 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms