Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgbl1Q8VDV0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgbl1Q8VDV0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms