Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgip1Q8VD37 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgip1Q8VD37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms