Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF0

Mavs, Mitochondrial antiviral-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MavsQ8VCF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MavsQ8VCF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MavsQ8VCF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms