Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef3Q8VCC8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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Rapgef3Q8VCC8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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Rapgef3Q8VCC8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rapgef3Q8VCC8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rapgef3Q8VCC8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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