Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc2Q8VBV3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms