Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
0610009B22RikQ8R3W2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
0610009B22RikQ8R3W2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
0610009B22RikQ8R3W2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
0610009B22RikQ8R3W2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms