Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk8Q8R3L8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk8Q8R3L8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk8Q8R3L8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms