Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc12Q8R344 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms