Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c5Q8R2T8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms