Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f4Q8R0K9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms