Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc5Q8K4Z2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc5Q8K4Z2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms