Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Colec12Q8K4Q8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colec12Q8K4Q8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms