Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw1Q8K4P8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw1Q8K4P8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms