Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn4Q8K3Q3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms