Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OptnQ8K3K8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms