Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms