Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sash3Q8K352 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sash3Q8K352 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms