Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms