Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fcho1Q8K285 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Fcho1Q8K285 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Fcho1Q8K285 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Fcho1Q8K285 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fcho1Q8K285 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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