Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms