Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a8Q8JZR6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a8Q8JZR6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms