Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afg3l2Q8JZQ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms