Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms