Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip3Q8CHD8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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