Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Cc2d2aQ8CFW7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms