Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms