Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms