Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms