Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc38Q8CDN8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc38Q8CDN8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc38Q8CDN8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms