Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc87Q8CDL9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc87Q8CDL9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms