Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RybpQ8CCI5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms